В Гражданскую войну командовал армией, Южной группой войск Восточного фронта и Восточным фронтом при разгроме армий А.В. Колчака; Туркестанским фронтом; Южным фронтом при разгроме войск П.Н. Врангеля.
). В начале апреля 1918 г. добровольно вступил в Красную армию. 1918–1919 гг. – командующий Восточным фронтом. 1919–1924 г. – главнокомандующий вооружёнными силами Республики и член РВСР
Один из организаторов Добровольческой армии, с апреля 1918 г. – её командующий, с января 1919 г. по апрель 1920 г. – Главком Вооружённых сил Юга России.