Помимо цветового кода для главных ветвей можно создать и другие коды для обозначения взаимосвязи между разными областями интеллект-карты. Эти коды могут быть достаточно простыми, например в форме точек и тире, в форме окружностей, треугольников и квадратов, помещенных вокруг интеллект-карты, или же в форме более сложных символов — возможно, даже в 3D.