Во время естественных родов плод проходит по родовым путям и неизбежно сглатывает содержимое влагалища, а затем контактирует с кожей матери. Занесенные таким образом в кишечник бактерии, не встретив сопротивления, немедленно колонизируют всю пищеварительную систему. Если ребенок находится на грудном вскармливании, то в его организм попадает еще больше «хороших» бактерий с молоком матери. В случае кесарева сечения все обстоит иначе, потому что в первую очередь новорожденный сталкивается с бактериями, живущими в родильном отделении, на коже врачей, проводивших операцию, и на всем том, с чем он контактирует в первые часы жизни.