Второй скрининг проводится на сроке от 16-й до 19-й недели и также включает в себя УЗИ и анализ крови (на хорионический гонадотропин человека, альфа-фетопротеин (АФП) и свободный эстриол). Во время УЗИ теперь измеряют другие параметры плода: размер между теменными буграми, окружность головы, живота, длину бедренных костей и т. д., а также оценивают структуру отдельных внутренних органов плода на наличие в них нарушений в развитии.