Аэробные бактерии, нуждающиеся в кислороде, живут в верхнем слое. В нижнем слое находятся анаэробные бактерии, способные жить там, где кислорода нет. При глубокой перекопке происходит смешивание слоев почвы, бактерии погибают, а на их восстановление нужен не один год. Кроме того, в почве зимуют лягушки, весьма полезные для садового участка. При сплошной перекопке почвы они погибают.