Происходившие на протяжении XIX столетия во Франции смены политического режима приводили к закрытию одних факультетов и открытию других, что привело к фрагментации научно-образовательной среды, узкой специализации институтов и отсутствию новых университетских центров. Специализированный характер высших учебных заведений и сложная система статусов в большой степени продолжают определять специфику французского высшего образования по сей день. Проведение научных исследований было ограничено стенами столичных институтов и научных обществ, в то время как функции большинства факультетов, институтов и коллежей были преимущественно образовательными при строгом контроле за содержанием учебных курсов. Высшие учебные заведения финансировались почти исключительно за счет взносов за обучение, не получали дополнительной поддержки от государства, что ограничивало ресурсы для их развития.