Период Второго Храма. В 538 г. до н. э., после завоевания Вавилонской империи персами, царь Кир, или Куруш, издал декрет, разрешивший еврейским изгнанникам вернуться на родину, восстановить Иерусалим и отстроить Храм. (Надо сказать, что уже в VI в. до н. э. этот мудрый правитель создал на просторах своей огромной империи прообраз многонационального государства типа будущего СССР, которое просуществовало горазло дольше советской империи и где в мире и согласии жили люди десятков и сотен племен и народностей.)
Кир приказал также вернуть в Иерусалим храмовую утварь, увезенную Навуходоносором, а также оплатить из казны расходы по постройке Храма. Кир оказался «сионистом» в большей степени, чем многие евреи: вернулась – в несколько приемов – лишь меньшая часть народа. Храм был отстроен заново к 516 г., и с этого момента начинается эпоха Второго Храма. Во Втором Храме уже не было скрижалей с Десятью заповедями – они таинственно исчезли незадолго до разрушения Первого Храма, и сегодня никто не знает, где они находятся.
Сам же город оставался малозаселенным, а городская стена разрушенной, и только в 445 г. иудейский правитель Нехемия провел ряд серьезных реформ, направленных на возвращение Иерусалиму статуса реальной столицы Иудеи. Он же обнес город новой крепостной стеной. Современник Нехемии, выдающийся еврейский законоучитель Эзра, учредил в Иерусалиме высший орган еврейского самоуправления – Кнессет а-Гдола (Великое Собрание), в который входило 120 мудрецов.
До 332 г. до н. э. Иерусалим продолжал оставаться столицей персидской провинции Иудеи.
В 332 г. до н. э. Иудея и Иерусалим без сопротивления покорились Александру Македонскому, который подтвердил привилегии, данные Иерусалиму персидскими правителями. Во время войн диадохов после смерти Александра (323 г. до н. э.) Иерусалим был захвачен (по-видимому, в конце IV в. до н. э.) и частично разрушен правителем Египта Птолемеем I Сотером, установившим контроль над Иудеей. Многие жители столицы были уведены в плен. Однако власть Птолемеев (301 г. до н. э.) принесла Иудее процветание; страна получила широкую внутреннюю автономию. Административный аппарат во главе с первосвященниками находился именно в Иерусалиме, Иерусалимский храм служил центром религиозной и общественной жизни столицы и всей страны. Здесь же сосредоточивается духовная и светская знать страны, завязавшая тесные связи с двором Птолемеев и греческой аристократией Египта.