Штурм города начался в 23 часа 25 февраля 1992 г. Сначала был проведен массированный обстрел Ходжалы. После нескольких часов боя население из города начало бежать в сторону Агдама. Как указано в отчете правозащитной организации «Мемориал», люди уходили по двум направлениям: с восточной окраины города на северо-восток вдоль русла реки, оставляя Аскеран слева, а также с северной окраины города на северо-восток, оставляя Аскеран справа.[68]