Участие 366-го МСП в Ходжалинском геноциде полностью доказано. Только в первые дни после ходжалинских событий прокуратурой Азербайджанской республики было допрошено около 200 свидетелей, из которых 162 подтвердили участие полка в захвате Ходжалы и убийстве мирных жителей.