Горы занимают три четверти территории Японии. На острове Хонсю находится самая высокая гора Японии – Фудзияма (высота 3776 метров), которую японцы считают священной. Это действующий вулкан в форме правильного конуса с глубоким кратером. 10 месяцев в году вершина его покрыта снегом.
В горах часты землетрясения, не редкость здесь и извержения вулканов, которых в Японии насчитывается около 150. После подводных землетрясений возникают огромные волны – цунами, которые обрушиваются на берега и разрушают постройки на них. Особенно разрушительные цунами бывают у острова Хоккайдо и северных берегов Хонсю.
В июле и августе над островами часто проходят тайфуны. Небо покрывается облаками, дует ураганный ветер, идут долгие проливные дожди. Во время тайфунов могут возникать огромные волны. Тайфуны приносят большие беды, вызывают наводнения, губят посевы. В год через Японию проходят 10–15 тайфунов.