Например, при синдроме раздраженного кишечника (СРК), по мнению ученых, иммунная реакция в кишечнике приводит к изменениям в секреции пищеварительных ферментов или в перистальтике и способности чувствовать боль. Эта иммунная реакция затем стимулирует выработку воспалительных веществ, вызывающих усталость. Другие расстройства, в том числе воспаления ЖКТ (в частности, язвенный колит), характеризуются воспалением в определенной части кишечника, что может частично объяснить усталость, связанную с этими заболеваниями.