До недавнего времени гендерное несоответствие считалось отклонением. В первом Диагностическом и статистическом руководстве Американской психиатрической ассоциации, опубликованном в 1952 году, гендерное несоответствие описывается под заголовком «Сексуальные отклонения». Во втором Руководстве, опубликованном в 1968 году, сохранилась та же классификация, хотя к тому моменту «Отчеты Кинси» о сексуальном поведении в США расширили взгляды общества на половые отличия. В третьем Руководстве, опубликованном в 1980 году, появился новый заголовок: «Расстройство гендерной идентичности», который сохранился и в четвертой версии 1994 года. В пятом Руководстве, вышедшем в 2013 году, термин «расстройство» был заменен словом «дисфория», то есть состояние, при котором человек чувствует себя несчастным. Этот термин тоже подвергся критике, так как он целиком исключал тех, кого абсолютно устраивает приобретенный гендер. Теперь используется более нейтральный термин – «расхождение».