Амниоцентез возможно проводить на сроке 16–19 недель. При этом исследовании точно так же, путем введения иглы в полость матки забирают небольшое количество околоплодной жидкости, в которой содержатся клетки плода, а также много других веществ, позволяющих оценить не только генетическое состояние плода, но и отклонения в развитии беременности. Как и в случае с биопсией хориона, риск пребывания беременности после этой процедуры также присутствует и составляет не более 0,5–0,8%