Третья сложность обусловлена, как это ни парадоксально, всё более высокой чувствительностью применяемого оборудования: с уменьшением количества необходимых для анализа клеток растет опасность кросс-контаминации образцов. А это ведет к целой цепочке последующих трудностей и проблем,