Как и все колумбийские сорта, зерна плантаций Нариньо подвергаются влажному способу очистки. При этом мякоть кофейной вишни отделяется в результате процесса ферментации в водяных чанах, а кофейные бобы проходят дополнительную стадию сортировки и отбора. Кофейные зерна после правильной ферментации приобретают тонкий аромат и красивый внешний вид (после обжарки такие зерна Арабики обладают характерной светлой прожилкой в центре).