Причины конфликта между академией и Н. С. Хрущевым называют разные. Согласно одной из версий гнев советского лидера вызвала статья двух профессоров Тимирязевки «О системе земледелия». Дело в том, что Никита Сергеевич резко выступал против травопольной системы, решив «осчастливить» страну кукурузой. Авторов статьи он заклеймил как «горе-ученых». «Нечего по асфальту пахать», – безапелляционно заявил советский лидер.
Была и другая версия: поговаривали, что мстил академии Н. С. Хрущев за то, что та отказала ему в выдаче диплома о высшем образовании. Правда это или нет судить трудно, но в 1960-е гг. многим хотелось в это верить.
Сын Н. С. Хрущева – Сергей, в своих мемуарах приводит собственную версию: отец хотел устроить в СССР обучение сельскому хозяйству по американскому образцу, приблизив ученых и студентов к земле.