Помимо особо важных политических заключенных в казематах бастионов и куртин Петропавловской крепости содержались подследственные по уголовным делам. Среди первых узников «русской Бастилии» оказались в 1718 году сын Петра I царевич Алексей и другие обвиняемые по «царевичеву делу», содержавшиеся в Трубецком бастионе.