Не все токсины, влияющие на кишечный мозг, поступают из окружающей среды. Некоторые из них вырабатываются паразитами в кишечнике, а другие возникают в результате расщепления гормонов. Эти токсины называются эндогенными, потому что появляются внутри организма.